Успешно добравшись до квартиры Даны, Мерсер сначала спасает сестру от незваных гостей, а затем находит убежище в небольшой частной квартире. Впоследствии он узнает о еще одной таинственной личности, которую держат в стенах корпорации "GENTEK", точнее говоря, на пятьдесят первом этаже головного офиса. Ею оказывается девушка, на вид лет восемнадцати, которая была занесена в централизованную базу данных под кодовым названием "Mother" известна еще как - Элизабет Энн Грин. Недолго думая над возможными последствиями, протагонист решает освободить ее из плена, совершенно не подозревая, какую страшную биологическую угрозу собирается выпустить на улицы Нью-Йорка.
Не сложно догадаться, что его действия становится начальной точкой масштабной биологической эпидемии, в результате которой погибнут десятки тысяч мирных жителей. Как следствие, об этом инциденте очень быстро становится известно правительству США, а на остров Манхэттен прибывают части регулярной армии и морской пехоты. Вместе с ними на специальном авианосце появляется корпус бойцов "Blackwatch" - мастерски подготовленных специалистов, ответственных за прямую борьбу или локализацию последствий биологических и вирусных вспышек.
На улицах города начинается настоящий хаос, который очень быстро перерастает в отдельные кровавые противостояния между военными и зараженными вирусом гражданскими. Среди всех этих событий Алекс, который допустил страшную ошибку, и теперь решает остановить Элизабет. Он ставит своей целью покончить с вирусом раз и навсегда, найти и наказать виновных, а также, если повезет, попробовать вылечить себя от заражения, отыскав хоть какие-то лекарства.
Core gameplay представлял собой особый микс ураганного экшена и примитивного стелса. Дело в том, что за счет вируса главный герой получил необычайную силу, ловкость и выносливость. К этому же уникальной стала и возможность менять свое тело на молекулярном уровне за счет нескольких способностей, разделенных на три отдельных направления: атакующие, защитные и сенсорные. Например, Алекс за считанные секунды может превратить свои руки в острые, как бритва, когти, как у Росомахи или в два гигантских твердых, как камень, молота, которые чем-то похожи на руки голема.
Но это еще не весь доступный арсенал: смертоносный меч, хлыст и увеличение мышечной массы в несколько десятков раз, тоже пригодятся при борьбе с противниками. Для защиты от вражеского огня Мерсер пользуется специальным щитом или умеет покрывать свое тело с ног до головы слоем высокопрочной брони, способной выдерживать попадания нескольких танковых снарядов или управляемых ракет - некий импровизированный костюм Тони Старка. Сенсорные способности представляют собой инфракрасное зрение, что поможет легче выявить противников скрытых за клубами дыма и зрение зараженного, который понадобится только в одной из сюжетных миссий. Девушки по вызову всегда славились своими умениями доставить удовольствие необычным способом, путаны Санкт-Петербурга обладают всяческими полезными техниками и уж точно смогут удивить вас в постели.
